肛周脓肿根治术后还肛瘘的原因大概有以下几个：
1、肛周脓肿是由于肛腺感染引起，一般在肛管和直肠部有原发病灶即内口，90%的内口都为隐形的，需要在手术操作的过程中，从脓肿切开以后进行探查，有些复杂的肛周脓肿内口可能无法探查，导致定位不准确，从而无法处理到真正的内口，导致术后肛瘘发生。
2、复杂的肛周脓肿会形成多个纤维隔，如果纤维隔没有清除，引流不通畅，感染依然存在，后期形成肛瘘的可能性就更大。
肛周脓肿与身体其它部位脓肿有所不同，一旦发现肛周化脓的情况，应该尽早的及时的进行手术。手术有两种方法，包括单纯切开引流术和一次性根治术，肛周脓肿根治术一般术后不容易形成肛瘘，可以达到一次性治愈。
